Ecological Archives E084-018-A2

Emilio M. Bruna.  2003.  Are plant populations in fragmented habitats recruitment limited? Tests with an Amazonian herb. Ecology 84:932–947.

Appendix B. Transition probability matrices describing the dynamics of the 13 Heliconia acuminata populations used in this study.  The stage class a plant is in is defined by the number of vegetative shoots it has with the exception of seedlings, which all have 1 shoot.  Plots locations are shown in Bruna and Kress (2002). 

Transition year 1998–1999

  FF-1
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0002

0.0007

0.0000

1

0.8750

0.4722

0.2500

0.1143

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.5000

0.5156

0.2000

0.0909

0.0000

3

0.0000

0.0000

0.1406

0.5429

0.2727

0.3333

4

0.0000

0.0278

0.0469

0.1143

0.3636

0.6667

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0286

0.2727

0.0000

             

FF-2 

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0016

1

1.0000

0.2800

0.1628

0.0385

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.5200

0.3953

0.2308

0.0000

0.0000

3

0.0000

0.1600

0.3488

0.4615

0.3750

0.2500

4

0.0000

0.0000

0.0465

0.2308

0.3750

0.2500

> 5

0.0000

0.0000

0.0233

0.0000

0.2500

0.5000

             

 FF-3

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0027

0.0597

0.0380

0.0253

1

1.0000

0.3600

0.0513

0.0833

0.0000

0.2500

2

0.0000

0.4400

0.4872

0.2083

0.1429

0.0000

3

0.0000

0.1600

0.3333

0.2083

0.1429

0.2500

4

0.0000

0.0000

0.1026

0.3750

0.1429

0.0000

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.1250

0.4286

0.5000

             

 FF-4

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0002

0.0000

0.0003

0.0005

0.0018

1

0.5000

0.4375

0.2222

0.0976

0.0714

0.0000

2

0.0000

0.4062

0.4762

0.1951

0.2857

0.0000

3

0.0000

0.0937

0.2857

0.4634

0.3571

0.2500

4

0.0000

0.0000

0.0159

0.1707

0.0714

0.3750

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0732

0.2143

0.3750

             

 FF-5

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0002

0.0002

0.0014

0.0018

1

1.0000

0.2222

0.2500

0.0465

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.5556

0.3889

0.1628

0.1500

0.1250

3

0.0000

0.1111

0.3611

0.4884

0.4000

0.0000

4

0.0000

0.0000

0.0000

0.2558

0.3000

0.2500

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0465

0.1500

0.6250

             

FF-6 

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0001

0.0003

0.0009

0.0025

1

1.0000

0.1071

0.1212

0.1042

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.6786

0.4242

0.1875

0.1364

0.0000

3

0.0000

0.1071

0.3535

0.3958

0.2273

0.1538

4

0.0000

0.0357

0.0808

0.1875

0.3636

0.2308

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.1250

0.2727

0.6154

             

 FF-7

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0004

0.0009

0.0021

0.0035

1

0.9475

0.2157

0.1752

0.0256

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.7059

0.2993

0.2308

0.1081

0.0000

3

0.0000

0.0588

0.3869

0.3932

0.3243

0.1379

4

0.0000

0.0000

0.1314

0.2308

0.2973

0.3103

> 5

0.0000

0.0000

0.0073

0.1197

0.2703

0.5517

             

CF-1 

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0230

0.0716

0.1052

0.2682

1

0.6667

0.5349

0.2481

0.0747

0.0412

0.0000

2

0.0000

0.4186

0.4496

0.3448

0.1134

0.0071

3

0.0000

0.0000

0.2558

0.3851

0.2990

0.1213

4

0.0000

0.0233

0.0233

0.1379

0.3402

0.2500

> 5

0.0000

0.0000

0.0076

0.0575

0.2062

0.6214

             

 CF-2

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0061

0.0295

0.0243

0.1234

0.2323

1

0.9429

0.2769

0.0803

0.0182

0.0370

0.0000

2

0.0000

0.6154

0.3723

0.1364

0.0370

0.0435

3

0.0000

0.0615

0.4161

0.4091

0.3519

0.1087

4

0.0000

0.0308

0.1022

0.3000

0.3889

0.1522

> 5

0.0000

0.0000

0.0292

0.1364

0.1852

0.6957

             

 CF-3

           
 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0060

0.0038

0.0130

0.0238

0.0400

1

0.6818

0.2909

0.0882

0.0784

0.0102

0.0000

2

0.0000

0.4364

0.3765

0.2157

0.1122

0.0000

3

0.0000

0.1455

0.3706

0.3203

0.3265

0.1463

4

0.0000

0.0182

0.1176

0.2418

0.2653

0.1951

> 5

0.0000

0.0182

0.0294

0.1179

0.2653

0.6341

CF4: Plot not established.

CF5: Plot not established.

CF6: Plot not established.

Transition year 1999–2000

FF-1

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

 

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.0263

0.0460

1

0.5000

0.5000

0.3000

0.0278

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.4375

0.4750

0.3056

0.2143

0.0000

3

0.0000

0.0312

0.1875

0.3056

0.3571

0.0000

4

0.0000

0.0000

0.0375

0.3056

0.2857

0.2500

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0556

0.1429

0.7500

 

 FF-2

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0011

0.0007

0.0027

1

0.5000

0.4706

0.2553

0.0000

0.0833

0.0000

2

0.0000

0.4412

0.4681

0.3556

0.0833

0.0000

3

0.0000

0.0294

0.2766

0.4222

0.4167

0.0000

4

0.0000

0.0000

0.0000

0.2000

0.3333

0.3333

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0222

0.0833

0.6667

 

FF-3 

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0001

0.0003

0.0010

0.0015

1

0.8235

0.4667

0.1509

0.0667

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.3778

0.4528

0.2333

0.1250

0.0000

3

0.0000

0.0667

0.2830

0.4000

0.3750

0.1818

4

0.0000

0.0000

0.0755

0.2667

0.1875

0.0000

> 5

0.0000

0.0222

0.0189

0.0333

0.3125

0.8182

 

 FF-4

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0002

0.0000

0.0016

1

0.7143

0.6230

0.2817

0.0377

0.0714

0.0000

2

0.0000

0.2787

0.3662

0.3208

0.0714

0.0000

3

0.0000

0.0328

0.2676

0.3019

0.1429

0.3000

4

0.0000

0.0000

0.0563

0.2642

0.2857

0.2000

> 5

0.0000

0.0159

0.0000

0.0755

0.4286

0.5000

 

FF-5 

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0000

0.000

0.0007

1

0.5000

0.6875

0.1622

0.0233

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.2500

0.2973

0.3256

0.1818

0.0000

3

0.0000

0.0000

0.4865

0.3256

0.3636

0.0000

4

0.0000

0.0000

0.0541

0.2791

0.0909

0.2727

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0233

0.3182

0.7273

 

FF-6 

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0001

0.0002

0.0007

0.0012

1

0.8615

0.5362

0.1584

0.0282

0.0000

0.1000

2

0.0000

0.3623

0.4257

0.1549

0.2000

0.0000

3

0.0000

0.0725

0.3267

0.4366

0.1714

0.1000

4

0.0000

0.0000

0.0693

0.2958

0.4286

0.3500

> 5

0.0000

0.0000

0.0099

0.0845

0.2000

0.4500

 

 FF-7

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0008

0.0010

0.0022

1

0.8537

0.5833

0.1349

0.0076

0.0000

0.0233

2

0.0000

0.3333

0.3571

0.1439

0.0580

0.0465

3

0.0000

0.0463

0.3968

0.3788

0.2464

0.0465

4

0.0000

0.0185

0.0952

0.3106

0.3043

0.1395

> 5

0.0000

0.0000

0.0079

0.1515

0.3913

0.7442

 

 CF-1

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0030

0.0020

0.0263

0.0509

0.1288

1

0.7778

0.3947

0.1412

0.0380

0.0312

0.0000

2

0.0000

0.4912

0.4529

0.1646

0.0521

0.0339

3

0.0000

0.0351

0.3059

0.3418

0.2396

0.1017

4

0.0000

0.0351

0.0588

0.3228

0.2604

0.1525

> 5

0.0000

0.0175

0.0353

0.1266

0.4167

0.7119

 

 CF-2

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0028

0.0130

0.0351

0.0743

1

0.8400

0.5658

0.1654

0.0000

0.0000

0.0159

2

0.0000

0.3816

0.4016

0.1812

0.0732

0.0476

3

0.0000

0.0132

0.3622

0.4130

0.3171

0.1270

4

0.0000

0.0132

0.0630

0.2681

0.2927

0.2698

> 5

0.0000

0.0132

0.0079

0.1377

0.3171

0.5397

 

CF-3 

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0001

0.0004

0.0011

0.0016

1

0.8161

0.4048

0.1500

0.0299

0.0000

0.0000

2

0.0000

0.3810

0.3000

0.1497

0.0833

0.0000

3

0.0000

0.1190

0.4000

0.3772

0.1875

0.0921

4

0.0000

0.0238

0.1062

0.3114

0.4479

0.1842

> 5

0.0000

0.0000

0.0312

0.1317

0.2604

0.7237

 

 CF-4

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.00169

0.0095

0.0101

0.0276

0.0760

1

1.0000

0.3077

0.2258

0.0333

0.0000

0.1250

2

0.0000

0.6154

0.3871

0.3333

0.2000

0.1250

3

0.0000

0.0769

0.2903

0.3667

0.3000

0.0000

4

0.0000

0.0000

0.0968

0.2333

0.3000

0.2500

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0333

0.2000

0.5000

 

 CF-5

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0113

0.0000

0.0196

1

0.8519

0.2917

0.0556

0.0370

0.0769

0.0323

2

0.0000

0.5833

0.4444

0.0741

0.2308

0.0323

3

0.0000

0.0833

0.3333

0.1852

0.0769

0.0645

4

0.0000

0.0417

0.1667

0.4074

0.3077

0.1613

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.2963

0.3077

0.7097

 

 CF-6

 

Sdlg.

1

2

3

4

> 5

Sdlg.

0.0000

0.0000

0.0000

0.0122

0.0000

0.1403

1

0.9643

0.6970

0.3019

0.0200

0.1000

0.0769

2

0.0000

0.2121

0.3774

0.2200

0.1000

0.1538

3

0.0000

0.0606

0.3208

0.3200

0.1500

0.2308

4

0.0000

0.0303

0.0000

0.3600

0.3000

0.0769

> 5

0.0000

0.0000

0.0000

0.0800

0.3500

0.4615

Literature Cited

Bruna, E. M., and W. J. Kress. 2002.  Habitat fragmentation and the  demographic structure of an Amazonian understory herb (Heliconia acuminata).  Conservation Biology, in press.


[Back to E084-018]